RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec4fP70194 548 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctps2P70303 586 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncf4P97369 339 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnks2Q3UES3 1166 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf145Q5SWK7 663 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hamp2Q80T19 83 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc38a9Q8BGD6 560 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem154Q8C4Q9 181 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrip1Q8CBD1 1161 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acap1Q8K2H4 740 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mospd1Q8VEL0 213 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35b2Q91ZN5 431 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp6cQ9CQR6 305 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx12Q9ER00 274 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hao2Q9NYQ2 353 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spry1Q9QXV9 313 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CasrQ9QY96 1079 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh13Q9WTR5 714 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KcpQ3U492 1550 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RlfA2A7F4 1918 aa12.55□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r3A2AMT7 306 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem233D3Z1U7 110 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnc1P15388 511 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csrp3P50462 194 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ext2P70428 718 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp607aQ3TQG9 686 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab26Q504M8 260 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syce1lQ5D525 247 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bdkrb1Q61125 334 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox17Q61473 419 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tead4Q62296 427 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Far2Q7TNT2 515 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trit1Q80UN9 467 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mppe1Q80XL7 396 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr21Q8BX79 349 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grsf1Q8C5Q4 479 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd11Q8K4F5 307 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r79Q8R285 306 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc39cQ8VE09 580 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mark1Q8VHJ5 795 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crtc3Q91X84 619 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dctn2Q99KJ8 402 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mccc1Q99MR8 717 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc62E9PVD1 701 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp780bE9Q2S6 806 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-T24F8VQG4 363 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde9aO70628 534 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DdcO88533 480 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eci1P42125 289 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upp1P52624 311 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AdprhP54923 362 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrig1P70193 1091 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g5P97391 137 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nat9Q3UG98 241 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxr1Q3UTB7 268 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ip6k1Q6PD10 433 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina12Q7TMF5 413 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcr1Q810W6 351 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lair1Q8BG84 263 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Peli3Q8BXR6 445 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TpbglQ8C013 384 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc47a1Q8K0H1 567 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Appl1Q8K3H0 707 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OptcQ920A0 328 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clvs1Q9D4C9 354 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam83dQ9D7I8 585 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syvn1Q9DBY1 612 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il1rl2Q9ERS7 574 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fzd2Q9JIP6 570 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Racgap1Q9WVM1 628 aa12.54□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrg1A2BFE8 218 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam124aD3Z5V4 536 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp758E9QAA1 583 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr596F8VQ26 312 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrasO08989 208 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spp1P10923 294 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmx2P43687 273 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prox1P48437 737 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tial1P70318 392 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctps1P70698 591 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BmxP97504 651 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc185Q3V118 621 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc8bQ5DU41 803 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il15raQ60819 263 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxb3Q6XAS4 170 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt2a1Q80X89 528 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SvopQ8BFT9 548 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msantd1Q8BIL2 278 aa12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms