RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641480.1

CASC19-232, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

BASIC

Gene CASC19, Length 1,244 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-232ENST00000641480 TBL1XO60907 577 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RHOBTB1O94844 696 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PGLSO95336 258 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ANP32DO95626 131 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PRLP01236 227 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ADRB1P08588 477 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CD1DP15813 335 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HDCP19113 662 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PIK3R1P27986 724 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ARRB2P32121 409 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HMGCLP35914 325 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 AVPR1AP37288 418 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ABCG1P45844 678 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GLRBP48167 497 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PSMD8P48556 350 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CLCN2P51788 898 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 EPHA5P54756 1037 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 EPHB1P54762 984 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 STX1BP61266 288 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SLC34A1Q06495 639 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 DMWDQ09019 674 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 DLG1Q12959 904 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GRIK2Q13002 908 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 USP4Q13107 963 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 STX5Q13190 355 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HTR4Q13639 388 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GALNT3Q14435 633 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GPR33Q49SQ1 333 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 COQ5Q5HYK3 327 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ISCA2Q86U28 154 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CUZD1Q86UP6 607 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LSMEM2Q8N112 164 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KYQ8NBH2 561 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FIBINQ8TAL6 211 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 NETO1Q8TDF5 533 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 OTUB2Q96DC9 234 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 THTPAQ9BU02 230 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 LRRC42Q9Y546 428 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ARL5AQ9Y689 179 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 DYTNA2CJ06 578 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 C2orf78A6NCI8 922 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FAM170BA6NMN3 283 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 A8MUI8 341 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 E9PBE3 544 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SDHDO14521 159 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GIPC1O14908 333 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 TEX28O15482 410 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 GREM1O60565 184 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 KLHL41O60662 606 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CHEK2O96017 543 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CHRNGP07510 517 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.261e-5■■■□□ 15.8
CASC19-232ENST00000641480 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 ITGALP20701 1170 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 FSHRP23945 695 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SERPINA4P29622 427 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 RGS4P49798 205 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 MTTPP55157 894 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 CDKN2DP55273 166 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 PKNOX1P55347 436 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 IL2P60568 153 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC19-232ENST00000641480 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms