RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	SPTA1	P02549	2419 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	SYCE3	A1L190	88 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	CDC14C	A4D256	554 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	KMO	O15229	486 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	MTSS1	O43312	755 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	CDK14	O94921	469 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFA10	O95299	355 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TIAF1	O95411	115 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	KRT7	P08729	469 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	BPI	P17213	487 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	MLLT10	P55197	1068 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	FOXK1	P85037	733 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	GPR18	Q14330	331 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	ESX1	Q8N693	406 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	FATE1	Q969F0	183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TRIB3	Q96RU7	358 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TCF4-262	ENST00000628078	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CHUK	O15111	745 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GPR39	O43194	453 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A9	O60656	530 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SPAG6	O75602	509 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	C9	P02748	559 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A6	P19224	532 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A1	P22309	533 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A4	P22310	534 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CA5A	P35218	305 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TPM4	P67936	248 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CDK18	Q07002	472 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SEPT6	Q14141	434 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	APOL1	O14791	398 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MAST4	O15021	2626 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJB5	O75953	348 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KRT1	P04264	644 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NTRK1	P04629	796 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	IDS	P22304	550 aa		13.26	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms