RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PRKD3O94806 890 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF15O94989 841 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EPN2O95208 641 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 VDRP11473 427 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN3P20807 821 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KCNA5P22460 613 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 RRM2P31350 389 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GGT5P36269 586 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ARSFP54793 590 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GIPC2Q8TF65 315 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EXT2Q93063 718 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS12Q96DT0 336 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KLRG1Q96E93 195 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 VPS39Q96JC1 886 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C3orf30Q96M34 536 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GPR78Q96P69 363 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LHX5Q9H2C1 402 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 UBP1Q9NZI7 540 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 OPTCQ9UBM4 332 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0J9YYE9 177 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC154A6NI56 674 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EVPLLA8MZ36 301 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GABARAPO95166 117 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KRT6AP02538 564 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KRT6BP04259 564 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LCKP06239 509 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GSTM1P09488 218 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 STAG3L1P0CL83 205 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 HOXD10P28358 340 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GSK3BP49841 420 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LIMK2P53671 638 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K7CLP57077 242 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 IL5RAQ01344 420 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZMYND11Q15326 602 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ACOT1Q86TX2 421 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ERO1BQ86YB8 467 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CCNYQ8ND76 341 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 REPS2Q8NFH8 660 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FRS2Q8WU20 508 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CDT1Q9H211 546 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SIX4Q9UIU6 781 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRFP10586 1907 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK1O00180 336 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SLC1A7O00341 560 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NAGAP17050 411 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PGAM1P18669 254 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2F1P24903 491 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 KCNAB2Q13303 367 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SQLEQ14534 574 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PELI3Q8N2H9 469 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SVOPQ8N4V2 548 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FBXL6Q8N531 539 aa8.12□□□□□ -1.11
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