RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.01■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 TRABDQ9H4I3 376 aa18.01■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.01■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 UBP1Q9NZI7 540 aa18.01■□□□□ 0.47
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CTIF-206ENST00000588345 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
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CTIF-206ENST00000588345 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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CTIF-206ENST00000588345 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.98■□□□□ 0.47
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CTIF-206ENST00000588345 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa17.97■□□□□ 0.47
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CTIF-206ENST00000588345 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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CTIF-206ENST00000588345 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 HLA-DPA1P20036 260 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 SPAM1P38567 509 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 CHRNA4P43681 627 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 MARCKSL1P49006 195 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 ABHD18Q0P651 414 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 MPP3Q13368 585 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 GTF2H3Q13889 308 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 MAP7Q14244 749 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-206ENST00000588345 NOMO1Q15155 1222 aa17.97■□□□□ 0.47
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