RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580948.1

LINC00511-211, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 3

Gene LINC00511, Length 475 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-211ENST00000580948 SEPT6Q14141 434 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 NR0B2Q15466 257 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ARL10Q8N8L6 244 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 FAM46DQ8NEK8 389 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GPR156Q8NFN8 814 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 LRRC45Q96CN5 670 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 RMI1Q9H9A7 625 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CPED1A4D0V7 1026 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 AGAP14A8MT82 685 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GRID2O43424 1007 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SLC28A2O43868 658 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 VEGFDO43915 354 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 KRT14P02533 472 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GP1BAP07359 652 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GPR89BP0CG08 455 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TPSB2P20231 275 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ACTR1BP42025 376 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 LMAN1P49257 510 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 VPS41P49754 854 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ARSDP51689 593 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ACTR1AP61163 376 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 DAB2P98082 770 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CDK16Q00536 496 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GPS1Q13098 491 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 NFATC2Q13469 925 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ITGA9Q13797 1035 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 LRP8Q14114 963 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 KCNJ11Q14654 390 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TPSAB1Q15661 275 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC38Q502W7 563 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 PERM1Q5SV97 790 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF534Q76KX8 674 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 IFI44Q8TCB0 444 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF398Q8TD17 642 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GLMNQ92990 594 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GULP1Q9UBP9 304 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 APPL1Q9UKG1 709 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 PADI4Q9UM07 663 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.12□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC78A2IDD5 438 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 A6NCN8 305 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 B4DGG1 531 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 H7C0S8 307 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 OPA1O60313 960 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CDK14O94921 469 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 EML2O95834 649 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ACP5P13686 325 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 HADHAP40939 763 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 RPIAP49247 311 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CLCNKAP51800 687 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CTSCP53634 463 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 CRADDP78560 199 aa9.11□□□□□ -0.95
LINC00511-211ENST00000580948 TMPRSS15P98073 1019 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms