RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 LMO7DNF2Z398 122 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TP73O15350 636 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 YY2O15391 372 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 VEGFDO43915 354 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 OPA1O60313 960 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 RASGRP1O95267 797 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PRAMEF1O95521 474 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 MT-CO3P00414 261 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SLC4A1P02730 911 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CEACAM5P06731 702 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 IVLP07476 585 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ANXA6P08133 673 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ITGALP20701 1170 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 MGAT1P26572 445 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 HK3P52790 923 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ITGA8P53708 1063 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CALCOCO2Q13137 446 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NFATC2Q13469 925 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PEX6Q13608 980 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SEPT6Q14141 434 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ALS2CLQ60I27 953 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TMEM135Q86UB9 458 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CCNJLQ8IV13 435 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 HID1Q8IV36 788 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PDIK1LQ8N165 341 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ZNF398Q8TD17 642 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 LRRC61Q9BV99 259 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 LGR4Q9BXB1 951 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CLPBQ9H078 707 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SYBUQ9NX95 663 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 KLQ9UEF7 1012 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 KCTD3Q9Y597 815 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PTPRBP23467 1997 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-209ENST00000580646 PRSS38A1L453 326 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CPED1A4D0V7 1026 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 TMEM202A6NGA9 273 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 E7ESA3 106 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 29.8
GGA3-209ENST00000580646 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 NUAK1O60285 661 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 USP1O94782 785 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 TTC4O95801 387 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 TNFP01375 233 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 GP1BAP07359 652 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CTSEP14091 401 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 MC4RP32245 332 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 RPIAP49247 311 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CACNG1Q06432 222 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 PTPRCAPQ14761 206 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 ELOCQ15369 112 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 NR0B2Q15466 257 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CHRNA6Q15825 494 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 ALG11Q2TAA5 492 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CCDC38Q502W7 563 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CNPY4Q8N129 248 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 IFI44Q8TCB0 444 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 GLMNQ92990 594 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 NXPE2Q96DL1 559 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 BOCQ9BWV1 1114 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 ABCG4Q9H172 646 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 ASB8Q9H765 288 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 FGF22Q9HCT0 170 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 RAXQ9Y2V3 346 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 SNX24Q9Y343 169 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.77□□□□□ -0.85
GGA3-209ENST00000580646 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms