RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.7□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.7□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.7□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CCDC78A2IDD5 438 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CTAGE9A4FU28 777 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 FAM149AA5PLN7 773 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 KMOO15229 486 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GRID2O43424 1007 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 VEGFDO43915 354 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 NUAK1O60285 661 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A9O60656 530 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 SNX2O60749 519 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 MTX2O75431 263 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CDK14O94921 469 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PRAMEF1O95521 474 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 KRT14P02533 472 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 FUCA1P04066 466 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GP1BAP07359 652 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ACP5P13686 325 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 VCLP18206 1134 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A6P19224 532 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 MSH3P20585 1137 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ITGALP20701 1170 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A1P22309 533 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A4P22310 534 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A3P35503 534 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A5P35504 534 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PAFAH1B1P43034 410 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 VPS41P49754 854 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 LAMB3Q13751 1172 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 LRP8Q14114 963 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PTPRCAPQ14761 206 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PYCR3Q53H96 274 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 HES3Q5TGS1 186 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 KCTD11Q693B1 232 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GUSBP11Q6P575 273 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 LRRTM4Q86VH4 590 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PRELID2Q8N945 189 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 KYQ8NBH2 561 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZNF398Q8TD17 642 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.69□□□□□ -1.18
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SMG6-211ENST00000572369 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 VPS35Q96QK1 796 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 BOCQ9BWV1 1114 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZMYND15Q9H091 742 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 IL26Q9NPH9 171 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 KLC4Q9NSK0 619 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
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SMG6-211ENST00000572369 KCNK6Q9Y257 313 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 KCTD3Q9Y597 815 aa7.69□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 A0A1B0GTL3 188 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 HEATR9A2RTY3 570 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 AP3B1O00203 1094 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 CES2O00748 559 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZNF185O15231 689 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 ZW10O43264 779 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 OPA1O60313 960 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 DNAJC6O75061 913 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 PHF2O75151 1096 aa7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
SMG6-211ENST00000572369 GPR89BP0CG08 455 aa7.68□□□□□ -1.18
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