RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	UBASH3A	P57075	661 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SPAG1	Q07617	926 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CDT1	Q9H211	546 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	HES2	Q9Y543	173 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PCNT	O95613	3336 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MYH11	P35749	1972 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SYN3	O14994	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK13	O15264	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	OGT	O15294	1046 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UGDH	O60701	494 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ADCY5	O95622	1261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINC1	P01008	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CLTB	P09497	229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PRR35	P0CG20	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MCF2	P10911	925 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	AXL	P30530	894 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CPA2	P48052	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GCLM	P48507	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	VAMP7	P51809	220 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF75D	P51815	510 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TPM4	P67936	248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HSF1	Q00613	529 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	EFR3A	Q14156	821 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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