RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 URADA6NGE7 173 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 POM121CA8CG34 1229 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 NUAK1O60285 661 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 WEE2P0C1S8 567 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 C17orf99Q6UX52 265 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 TO15178 435 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF862O60290 1169 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 CDH26Q8IXH8 852 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 HASPINQ8TF76 798 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 PP2D1A8MPX8 630 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SYT16Q17RD7 645 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SVIPQ8NHG7 77 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CYGBQ8WWM9 190 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TEKT5Q96M29 485 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB18Q96M61 343 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NPHS2Q9NP85 383 aa6.26□□□□□ -1.41
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