RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548821.1

GCN1-205, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 504 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-205ENST00000548821 RECKO95980 971 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 MMP2P08253 660 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 NDUFS1P28331 727 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 SPAM1P38567 509 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 FOXM1Q08050 763 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CARFQ8N187 725 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CNTD1Q8N815 330 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PATE1Q8WXA2 126 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 UBXN4Q92575 508 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 RTP4Q96DX8 246 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 C9orf72Q96LT7 481 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 OLFM3Q96PB7 478 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 RAB33BQ9H082 229 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 STARD5Q9NSY2 213 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 KCTD3Q9Y597 815 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 C5orf60A6NFR6 353 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CFAP99D6REC4 459 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 AGRPO00253 132 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PMPCBO75439 489 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 STK17BO94768 372 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CRTAMO95727 393 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TNNT1P13805 278 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TCN2P20062 427 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 MSH3P20585 1137 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 COMTP21964 271 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 MPSTP25325 297 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 HADHAP40939 763 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 GEMP55040 296 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 DYNLT1P63172 113 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ACY1Q03154 408 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ZBTB17Q13105 803 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 KRT33BQ14525 404 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ALS2CLQ60I27 953 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ANKS6Q68DC2 871 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 VASH2Q86V25 355 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 KMT5CQ86Y97 462 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 GPR26Q8NDV2 337 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 OR8K5Q8NH50 307 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 FCRL5Q96RD9 977 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 TRIB3Q96RU7 358 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CD180Q99467 661 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 IL17BQ9UHF5 180 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ANAPC2Q9UJX6 822 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PADI1Q9ULC6 663 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 ALG6Q9Y672 507 aa9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GCN1-205ENST00000548821 A6NCN8 305 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms