RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 KCTD3Q9Y597 815 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 AP3B1O00203 1094 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PPM1DO15297 605 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 B4GAT1O43505 415 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 KIF5CO60282 957 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ACP5P13686 325 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CCL7P80098 99 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PTPRCAPQ14761 206 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ARMC3Q5W041 872 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC35F6Q8N357 371 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SGSM3Q96HU1 749 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ASB8Q9H765 288 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ZZEF1O43149 2961 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TAF4O00268 1085 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CA5AP35218 305 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 MAZP56270 477 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 GPLD1P80108 840 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 GTF2H3Q13889 308 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PATE1Q8WXA2 126 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC25Q96NG3 672 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM74Q96NL1 305 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 MTX2O75431 263 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 EML2O95834 649 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ETS1P14921 441 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 VCLP18206 1134 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 MAGEA6P43360 314 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ACVR1Q04771 509 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP4F3Q08477 520 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 BCL7AQ4VC05 210 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 NXPE1Q8N323 547 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM159Q96B96 161 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 KCND1Q9NSA2 647 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 KLC4Q9NSK0 619 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SNX12Q9UMY4 172 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNK6Q9Y257 313 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 HEATR9A2RTY3 570 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CPNE6O95741 557 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 GAS8O95995 478 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ITGALP20701 1170 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ADRA1DP25100 572 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 EPHA4P54764 986 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SLITRK4Q8IW52 837 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 GDAP1Q8TB36 358 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 MDM1Q8TC05 714 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PDP2Q9P2J9 529 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 E7EVH7 732 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR39O43194 453 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 APRTP07741 180 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TPH1P17752 444 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TPSB2P20231 275 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNJ1P48048 391 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 CTSCP53634 463 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TPSAB1Q15661 275 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 INSCQ1MX18 579 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 AMZ2Q86W34 360 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms