RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544989.1

HDAC4-216, Transcript of histone deacetylase 4, human

TSL 5

Gene HDAC4, Length 342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC4-216	ENST00000544989	DUX1	O43812	170 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	AP2A1	O95782	977 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	RALB	P11234	206 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	MSH3	P20585	1137 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	IDS	P22304	550 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	ABCG1	P45844	678 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	PDX1	P52945	283 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	EPHA4	P54764	986 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	HHEX	Q03014	270 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC4-216	ENST00000544989	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PPM1D	O15297	605 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SNX2	O60749	519 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	JMJD7	P0C870	316 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ITGAL	P20701	1170 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UCN	P55089	124 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	OR1D5	P58170	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CCZ1B	P86790	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	NFATC2	Q13469	925 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CCNG2	Q16589	344 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AMZ1	Q400G9	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	BROX	Q5VW32	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PAK5	Q9P286	719 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989		A6NCN8	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989		E7EVH7	732 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AP3B1	O00203	1094 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	B4GAT1	O43505	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TNFSF15	O95150	251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	VIP	P01282	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	IFNB1	P01574	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CD1C	P29017	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AKT1	P31749	480 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A5	P35504	534 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	HAL	P42357	657 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	LMAN1	P49257	510 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	DMPK	Q09013	629 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CDH17	Q12864	832 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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