RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542484.1

C2CD3-218, Transcript of C2 calcium dependent domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene C2CD3, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3-218ENST00000542484 TSPAN4O14817 238 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 CYTH3O43739 400 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ATP5HO75947 161 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 MMP3P08254 477 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ZNF18P17022 549 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 CHRNB2P17787 502 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 CMA1P23946 247 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 NDUFA8P51970 172 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 NCALDP61601 193 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 HPCAP84074 193 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ZBTB17Q13105 803 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 ITGA9Q13797 1035 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 KRT32Q14532 448 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 MTF1Q14872 753 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 PARP6Q2NL67 630 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 NEPROQ6NW34 567 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 GDAP1Q8TB36 358 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 RAPGEF5Q92565 580 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 INPP5DQ92835 1189 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 SLC25A28Q96A46 364 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 LRRC45Q96CN5 670 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 KLHL29Q96CT2 875 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 USP28Q96RU2 1077 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PARVBQ9HBI1 364 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 PEMTQ9UBM1 199 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 RNF14Q9UBS8 474 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.55□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 SCINQ9Y6U3 715 aa4.55□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 PREX1Q8TCU6 1659 aa4.54□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 A0A087WWV3 80 aa4.54□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa4.54□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 KRT86O43790 486 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 TOMM40O96008 361 aa4.54□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 PSG1P11464 419 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 CTPS1P17812 591 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 TMOD1P28289 359 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 HOXD10P28358 340 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 AVPR1AP37288 418 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 VHLP40337 213 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PAFAH1B1P43034 410 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 POLD2P49005 469 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 RAD23BP54727 409 aa4.54□□□□□ -1.68
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C2CD3-218ENST00000542484 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 TUBA1BP68363 451 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 MPP1Q00013 466 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 C2orf54Q08AI8 447 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PTP4A2Q12974 167 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 BNIP1Q12981 228 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PTGR1Q14914 329 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 NECTIN1Q15223 517 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 PARP10Q53GL7 1025 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 SMUG1Q53HV7 270 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa4.54□□□□□ -1.68
C2CD3-218ENST00000542484 C8orf74Q6P047 294 aa4.54□□□□□ -1.68
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