RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535090.5

RAN-206, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAN, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-206	ENST00000535090	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	DPF1	Q92782	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	EXT2	Q93063	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090		A4D1N5	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	POM121B	A6NF01	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090		B4E1Z4	1266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PCDH17	O14917	1159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	VILL	O15195	856 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	CLDN3	O15551	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	B3GALT2	O43825	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	UBXN7	O94888	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	METTL18	O95568	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	FSHB	P01225	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	MMP1	P03956	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	LGALS2	P05162	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	IL6	P05231	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	FH	P07954	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	AR	P10275	920 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SLC9A1	P19634	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	MX1	P20591	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PCSK1	P29120	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	CRABP2	P29373	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SLC7A1	P30825	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SERPINB6	P35237	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SERPINF1	P36955	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	MTTP	P55157	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	STX17	P56962	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PRAME	P78395	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	OCRL	Q01968	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	CREM	Q03060	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	MGAT3	Q09327	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	NPRL3	Q12980	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	IL24	Q13007	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PGM5	Q15124	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-206	ENST00000535090	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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