RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 MMP9P14780 707 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 NR2F2P24468 414 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PON1P27169 355 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACTN2P35609 894 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FMO5P49326 533 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PSMC6P62333 389 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RUNX1T1Q06455 604 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARL16Q0P5N6 197 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MEP1AQ16819 746 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RILPL1Q5EBL4 403 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 WDR78Q5VTH9 848 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 WBP2NLQ6ICG8 309 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MZT2BQ6NZ67 158 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CEP97Q8IW35 865 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMTC2Q8N394 836 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC5A8Q8N695 610 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DNAAF4Q8WXU2 420 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PHF21AQ96BD5 680 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 LINGO1Q96FE5 620 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PGAM5Q96HS1 289 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FEM1CQ96JP0 617 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HGH1Q9BTY7 390 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HRH4Q9H3N8 390 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TCF7L2Q9NQB0 619 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TAAR2Q9P1P5 351 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 A0A1W2PP11 408 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ASPDHA6ND91 283 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR5K3A6NET4 321 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 J3QR06 171 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 LMX1BO60663 402 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF217O75362 1048 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DAB1O75553 588 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 BMP10O95393 424 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CRYAAP02489 173 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM106CPP0CH98 169 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 NMBRP28336 390 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC15A1P46059 708 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SUOXP51687 545 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DLX5P56178 289 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SPOCK1Q08629 439 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CHAF1BQ13112 559 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CUL4AQ13619 759 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCNC3Q14003 757 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 WTAPQ15007 396 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SYT16Q17RD7 645 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ALS2CLQ60I27 953 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF852Q6ZMS4 543 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 AACSQ86V21 672 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RFLNBQ8N5W9 214 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 THAP6Q8TBB0 222 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRPC4APQ8TEL6 797 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPP4R1Q8TF05 950 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM255BQ8WV15 326 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MOAP1Q96BY2 351 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CALML4Q96GE6 196 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 NODALQ96S42 347 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GFI1Q99684 422 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MXD3Q9BW11 206 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KLHL1Q9NR64 748 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TAS2R14Q9NYV8 317 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCNG2Q9UJ96 466 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRAG1Q86YV5 1406 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SCN5AQ14524 2016 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms