RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516896.1

RNU6-175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-175P-201ENST00000516896 PARP16Q8N5Y8 322 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MYCT1Q8N699 235 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF491Q8N8L2 437 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SCAIQ8N9R8 606 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SCCPDHQ8NBX0 429 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TMEM116Q8NCL8 245 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OR2T11Q8NH01 316 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PLBD2Q8NHP8 589 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CLEC4CQ8WTT0 213 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 DEDD2Q8WXF8 326 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 HSD17B8Q92506 261 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PHF21AQ96BD5 680 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MVB12AQ96EY5 273 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 LRRC46Q96FV0 321 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 LGMNQ99538 433 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATF6BQ99941 703 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NUDT22Q9BRQ3 303 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PITPNM3Q9BZ71 974 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 DPH1Q9BZG8 443 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NDST4Q9H3R1 872 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 C10orf88Q9H8K7 445 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 JPT2Q9H910 190 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MED20Q9H944 212 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NDE1Q9NXR1 346 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GRHL1Q9NZI5 618 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 COQ3Q9NZJ6 369 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TINAGQ9UJW2 476 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OGDHLQ9ULD0 1010 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLC39A10Q9ULF5 831 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PSG11Q9UQ72 335 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OSGIN2Q9Y236 505 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CAPN7Q9Y6W3 813 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 POGZQ7Z3K3 1410 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLIT3O75094 1523 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 A0A087X0B3 334 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 A0A0G2JNG1 304 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 VWA3AA6NCI4 1184 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OR6C76A6NM76 312 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 COLCA2A8K830 154 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PI4K2BG5E9Z4 385 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 DNM1LO00429 736 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GPR39O43194 453 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TGFB1I1O43294 461 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SNAI2O43623 268 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 BUD23O43709 281 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SCO2O43819 266 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 AIREO43918 545 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MED6O75586 246 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 STBD1O95210 358 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CER1O95813 267 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGLV1-47P01700 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGHEP01854 428 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 LIPFP07098 398 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ITGA5P08648 1049 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CYP3A4P08684 503 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 POU2F2P09086 479 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FAM200BP0CF97 657 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IRF1P10914 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PSG2P11465 335 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CYP4B1P13584 511 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TCF3P15923 654 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NCLP19338 710 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CYP2A7P20853 494 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RPA1P27694 616 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GGT5P36269 586 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RCAN1P53805 252 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CDK18Q07002 472 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PLA2G7Q13093 441 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GPR17Q13304 367 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATP1A4Q13733 1029 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 KIR2DS5Q14953 304 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TAF13Q15543 124 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ME3Q16798 604 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GXYLT1Q4G148 440 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ESCO2Q56NI9 601 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms