RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0G2JLW4	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331		A0A1W2PQM1	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FIBP	O43427	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TNFSF14	O43557	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BBOX1	O75936	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MMP2	P08253	660 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ITGAX	P20702	1163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	HOXD10	P28358	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	HOXC13	P31276	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CPOX	P36551	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	DSCR9	P59020	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZBED6	P86452	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TOMM20	Q15388	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GSTA3	Q16772	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331		J3KR12	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	E2F6	O75461	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	HOXB5	P09067	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF24	P17028	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MX1	P20591	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	AGA	P20933	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KIF5B	P33176	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KRT9	P35527	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PIGA	P37287	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GNAQ	P50148	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CASP6	P55212	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	COX10	Q12887	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ASIC2	Q16515	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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