RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510923.5

MRPL3-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L3, human

TSL 2

Gene MRPL3, Length 813 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL3-208	ENST00000510923	STK17B	O94768	372 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	C9	P02748	559 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TYRP1	P17643	537 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PTPN3	P26045	913 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	POLE2	P56282	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	IL17B	Q9UHF5	180 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	VEGFD	O43915	354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	UBXN7	O94888	489 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CDK14	O94921	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	DLGAP3	O95886	979 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	VIP	P01282	170 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	BRAF	P15056	766 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	COMT	P21964	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CDKN2B	P42772	138 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SLC1A1	P43005	524 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CSRP3	P50461	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SPOP	O43791	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TPM1	P09493	284 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	AMD1	P17707	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	NFKB1	P19838	968 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CCR10	P46092	362 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	NR2C2	P49116	596 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SEPHS1	P49903	392 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	FOXM1	Q08050	763 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CDC20	Q12834	499 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TAZ	Q16635	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CST8	O60676	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	ZNF28	P17035	718 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	IDS	P22304	550 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	HMGCL	P35914	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	STAT5A	P42229	794 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CHRNA4	P43681	627 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	CAPZB	P47756	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	WNT3A	P56704	352 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	SH3BP2	P78314	561 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	TFDP2	Q14188	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	MAP7	Q14244	749 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MRPL3-208	ENST00000510923	GPR18	Q14330	331 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms