RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 RBPJQ06330 500 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 TUFT1Q9NNX1 390 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 VPS8Q8N3P4 1428 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 A0A0U1RQF3 1178 aa2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf52A6NGY3 159 aa2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 YY2O15391 372 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SHMT1P34896 483 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC12A3P55017 1021 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 BICD2Q8TD16 824 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 CXorf56Q9H5V9 222 aa2.25□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
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