RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 IYDQ6PHW0 289 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SFRP1Q8N474 314 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SMOXQ9NWM0 555 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 FRYQ5TBA9 3013 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP99D6REC4 459 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 B4GAT1O43505 415 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 NFATC2Q13469 925 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 POU6F1Q14863 301 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 AMZ2Q86W34 360 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 OR10G6Q8NH81 332 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 STYXQ8WUJ0 223 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 FGF11Q92914 225 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SATB2Q9UPW6 733 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 KCTD3Q9Y597 815 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 PPM1DO15297 605 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 HALP42357 657 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 GPLD1P80108 840 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 NR1D2Q14995 579 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR33Q49SQ1 333 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 USP53Q70EK8 1073 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX20Q7Z614 316 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM159Q96B96 161 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 THSD1Q9NS62 852 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 RAXQ9Y2V3 346 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL33A6NCF5 533 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 AP3B1O00203 1094 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF4O00268 1085 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 LDB2O43679 373 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 VIPP01282 170 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 APRTP07741 180 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ETS1P14921 441 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 CCKBRP32239 447 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA5AQ13591 1074 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 PHF19Q5T6S3 580 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 CMKLR1Q99788 373 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 HEATR9A2RTY3 570 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2AG2A6NM03 316 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 DUX1O43812 170 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 SUN1O94901 812 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 EML2O95834 649 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 MC4RP32245 332 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC1Q99614 292 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 COPS8Q99627 209 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-210ENST00000505941 RDH14Q9HBH5 336 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms