RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 IL19Q9UHD0 177 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TLK1Q9UKI8 766 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGB4Q9UN71 923 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GBF1Q92538 1859 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PPL8 197 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GMNCA6NCL1 334 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AHRRA9YTQ3 701 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CLDN4O14493 209 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN4O14817 238 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ANGPT2O15123 496 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAMP1O15126 338 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HCRTR2O43614 444 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TOM1L1O75674 476 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GAT3O94766 335 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPLA2O95372 231 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HSD3B1P14060 373 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 OR3A3P47888 321 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STX1BP61266 288 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPPQ6IPU0 288 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TIGD4Q8IY51 512 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR48Q8TAF3 677 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MYDGFQ969H8 173 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXW5Q969U6 566 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC120Q96HB5 630 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM80Q96HE8 168 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGED4Q96JG8 741 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A23Q9BV35 468 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PQ72 361 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM170BA6NMN3 283 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 H7BY64 318 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6B1O95007 311 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINB1P30740 379 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 GP5P40197 560 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NAMPTP43490 491 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RESTQ13127 1097 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STX3Q13277 289 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TM4SF20Q53R12 229 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 SATL1Q86VE3 508 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RETREG3Q86VR2 466 aa4.54□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 COG4Q9H9E3 785 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ASAH2Q9NR71 780 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 B4GAT1O43505 415 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJB6O75190 326 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HTR3BO95264 441 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FHP07954 510 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00271P0C7V0 271 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGB6P18564 788 aa4.54□□□□□ -1.68
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