RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	VIT	Q6UXI7	678 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	GK5	Q6ZS86	529 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CHSY3	Q70JA7	882 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MTSS1L	Q765P7	747 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CHST9	Q7L1S5	443 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	HPS6	Q86YV9	775 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	APCDD1	Q8J025	514 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RIN3	Q8TB24	985 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LPGAT1	Q92604	370 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NXPE3	Q969Y0	559 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PLD4	Q96BZ4	506 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RCN3	Q96D15	328 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CNDP1	Q96KN2	507 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	BIRC8	Q96P09	236 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PSKH2	Q96QS6	385 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG9	Q9H6U8	611 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	BRD9	Q9H8M2	597 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ASB1	Q9Y576	335 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CPQ	Q9Y646	472 aa		5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730		F8W8V4	182 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	UBXN8	O00124	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CBX4	O00257	560 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LEFTY2	O00292	366 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC7	O00311	574 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TBL1X	O60907	577 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CLDN11	O75508	207 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TMCC1	O94876	653 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPAN12	O95859	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	OLFM2	O95897	454 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	IMPDH1	P20839	514 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FCAR	P24071	287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	WEE1	P30291	646 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FMO4	P31512	558 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	GK	P32189	559 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CSK	P41240	450 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	STC1	P52823	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	COPA	P53621	1224 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	EPHB1	P54762	984 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	INHBC	P55103	352 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CDH13	P55290	713 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A9	P82251	487 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZXDA	P98168	799 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PTK2B	Q14289	1009 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ACAP2	Q15057	778 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF11	Q15544	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKN3	Q16667	212 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRF1	Q5T601	910 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		5.76	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms