RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.56■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.56■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.56■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TRIM16O95361 564 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CAMK1Q14012 370 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TAF11Q15544 211 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TGFBIQ15582 683 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ZNF77Q15935 545 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 RTL10Q7L3V2 364 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CHST14Q8NCH0 376 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 GPR26Q8NDV2 337 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HIPK4Q8NE63 616 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HERVK_113Q902F9 699 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LYSMD1Q96S90 227 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CDRT15Q96T59 188 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 MCM8Q9UJA3 840 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PCTPQ9UKL6 214 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PER2O15055 1255 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TRIM24O15164 1050 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ANPEPP15144 967 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 SYN1P17600 705 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 VHLP40337 213 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 RBBP7Q16576 425 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ZNF570Q96NI8 536 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HGH1Q9BTY7 390 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CEP44Q9C0F1 390 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 WDR41Q9HAD4 459 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 BTRCQ9Y297 605 aa16.55■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 BAG2O95816 211 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 MYOGP15173 224 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HOXA9P31269 272 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 UBE3AQ05086 875 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CCNIQ14094 377 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 GPR33Q49SQ1 333 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 SERPINI1Q99574 410 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TUBB1Q9H4B7 451 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 NDE1Q9NXR1 346 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TMCO1Q9UM00 188 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ASB1Q9Y576 335 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 FKBP6O75344 327 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF15O94989 841 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LINC00032P0C843 101 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LHCGRP22888 699 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 GCKP35557 465 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 MAPRE2Q15555 327 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 MUM1Q2TAK8 710 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PRSS36Q5K4E3 855 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 NXPE1Q8N323 547 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LEMD2Q8NC56 503 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 LRRC42Q9Y546 428 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 TIMM22Q9Y584 194 aa16.54■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 MLYCDO95822 493 aa16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 WEE1P30291 646 aa16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PKNOX1P55347 436 aa16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 STX1BP61266 288 aa16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 PTSQ03393 145 aa16.53■□□□□ 0.24
TOM1-216ENST00000492723 STX5Q13190 355 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms