RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 TEKT4Q8WW24 435 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 WASF1Q92558 559 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 MTBPQ96DY7 904 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 HGH1Q9BTY7 390 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 HRH2P25021 359 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 OPA3Q9H6K4 179 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-212ENST00000491302 TADA2AO75478 443 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 LINGO3P0C6S8 592 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 IFNAR1P17181 557 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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