RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 NAGLUP54802 743 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 NR1H2P55055 460 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ECT2LQ008S8 904 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PDGFRLQ15198 375 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CDKN3Q16667 212 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MYLK3Q32MK0 819 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SPATS1Q496A3 300 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 RNF135Q8IUD6 432 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TTC16Q8NEE8 873 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 GPR150Q8NGU9 434 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MAPK15Q8TD08 544 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MYO19Q96H55 970 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 EXOC2Q96KP1 924 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MYADMQ96S97 322 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 NUF2Q9BZD4 464 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HPS4Q9NQG7 708 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SARDHQ9UL12 918 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.52□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 REV3LO60673 3130 aa9.52□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TARM1B6A8C7 271 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJA2O60884 412 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SOCS5O75159 536 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ADH1CP00326 375 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ADH5P11766 374 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ARSAP15289 507 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PSMC3P17980 439 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 EPHA3P29320 983 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ERFP50548 548 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 INHBCP55103 352 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 STX1BP61266 288 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GALNT3Q14435 633 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TLR1Q15399 786 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 DLG2Q15700 870 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PTPRNQ16849 979 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GEN1Q17RS7 908 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CARD16Q5EG05 197 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NEPROQ6NW34 567 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 VITQ6UXI7 678 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 KDM1BQ8NB78 822 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 HIC2Q96JB3 615 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CATSPER2Q96P56 530 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ASB2Q96Q27 587 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 LYSMD1Q96S90 227 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NDNQ99608 321 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 APOL5Q9BWW9 433 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TRANK1O15050 2925 aa9.51□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 H7C0S8 307 aa9.51□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ACOT8O14734 319 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms