RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 USP53Q70EK8 1073 aa26.45■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO39Q8N4B4 442 aa26.45■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM159Q96B96 161 aa26.45■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 FKBPLQ9UIM3 349 aa26.45■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 JRKLQ9Y4A0 524 aa26.45■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ASXL3Q9C0F0 2248 aa26.45■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SPEGQ15772 3267 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TPH1P17752 444 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 FASLGP48023 281 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 B4GALNT1Q00973 533 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 NFATC2Q13469 925 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPRCAPQ14761 206 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 OASLQ15646 514 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TBC1D25Q3MII6 688 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 GPRC6AQ5T6X5 926 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 RAB11FIP2Q7L804 512 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF438Q7Z4V0 828 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 AMZ2Q86W34 360 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DDHD1Q8NEL9 900 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CMKLR1Q99788 373 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 C19orf43Q9BQ61 176 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 RAB6BQ9NRW1 208 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 AKAP13Q12802 2813 aa26.44■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PPM1DO15297 605 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 B4GAT1O43505 415 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DUX1O43812 170 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 VIPP01282 170 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CCKBRP32239 447 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CXCR5P32302 372 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CDH17Q12864 832 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 POU6F1Q14863 301 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KCTD11Q693B1 232 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM220Q6QAJ8 160 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TLR10Q9BXR5 811 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 RDH14Q9HBH5 336 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ETNK1Q9HBU6 452 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM8Q9NQV8 689 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SMOXQ9NWM0 555 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KCTD3Q9Y597 815 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 EPG5Q9HCE0 2579 aa26.43■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 FRYQ5TBA9 3013 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PLD2O14939 933 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF5CO60282 957 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 NR1D2Q14995 579 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DENND5AQ6IQ26 1287 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 OR13C4Q8NGS5 318 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CXorf40BQ96DE9 158 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 PBKQ96KB5 322 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CPNE7Q9UBL6 633 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 IGF2RP11717 2491 aa26.42■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 RP1P56715 2156 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 MYLKQ15746 1914 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 POP7O75817 140 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFSF15O95150 251 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 MAPK9P45984 424 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR33Q49SQ1 333 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX20Q7Z614 316 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 JAMLQ86YT9 394 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF248Q8NDW4 579 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 STYXQ8WUJ0 223 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 COPS8Q99627 209 aa26.41■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KLHL33A6NCF5 533 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 OR2AG2A6NM03 316 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KRT37O76014 449 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DXOO77932 396 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 APRTP07741 180 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 MC4RP32245 332 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 FNBP1LQ5T0N5 605 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF449Q6P9G9 518 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 DET1Q7L5Y6 550 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 OR52K1Q8NGK4 314 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC46A1Q96NT5 459 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC1Q99614 292 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR70Q9NW82 654 aa26.4■■□□□ 1.82
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms