RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAF5Q15542 800 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAN2A1Q16706 1144 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ISXQ2M1V0 245 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 RETSATQ6NUM9 610 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 LILRA2Q8N149 483 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARL14Q8N4G2 192 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 IRGQQ8WZA9 623 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARRDC3Q96B67 414 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERPINB11Q96P15 392 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP29Q9HBJ7 922 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PREBQ9HCU5 417 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAI1Q9UI46 699 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SARDHQ9UL12 918 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLXNA2O75051 1894 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.21□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT19A8MXV4 375 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 O00370 1275 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCAMP1O15126 338 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MUSKO15146 869 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 AHSGP02765 367 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TACR2P21452 398 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TGM2P21980 687 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAPKAPK2P49137 400 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CUL2Q13617 745 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC12A1Q13621 1099 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 DLG2Q15700 870 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGBL4Q5VU57 503 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 RESP18Q5W5W9 173 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PMF1Q6P1K2 205 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM270Q6UE05 265 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q6ZSR6 202 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCML4Q8N228 414 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MUL1Q969V5 352 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL12RB2Q99665 862 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 BCO1Q9HAY6 547 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 DLL4Q9NR61 685 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRFN1Q9P244 771 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.2□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1B0GVL5 298 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 B9A039 149 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MCF2LO15068 1137 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 CETN3O15182 167 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRAMEF4O60810 478 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TGFB1P01137 390 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 GDNFP39905 211 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 ENPEPQ07075 957 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTM1Q13496 603 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPARCL1Q14515 664 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 COLEC12Q5KU26 742 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 PHF19Q5T6S3 580 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 LIN54Q6MZP7 749 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEK5Q6P3R8 708 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 GUSBP11Q6P575 273 aa7.19□□□□□ -1.26
APOBEC3G-206ENST00000486357 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms