RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481180.5

CCDC18-209, Transcript of coiled-coil domain containing 18, human

TSL 5

Gene CCDC18, Length 1,751 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC18-209	ENST00000481180	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	MIER2	Q8N344	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CSPG5	O95196	566 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	LINC00032	P0C843	101 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	BMP1	P13497	986 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PTPN2	P17706	415 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ITGB6	P18564	788 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	UGT1A6	P19224	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	UGT1A1	P22309	533 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	UGT1A4	P22310	534 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	HLA-F	P30511	346 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CA5A	P35218	305 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	UGT1A3	P35503	534 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	UGT1A5	P35504	534 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PSMD8	P48556	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	EPHA5	P54756	1037 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	BLMH	Q13867	455 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TEAD2	Q15562	447 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TGFBI	Q15582	683 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	GSTA3	Q16772	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	USP45	Q70EL2	814 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	DLG3	Q92796	817 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180		A0A1B0GTL3	188 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180		E7ENX8	843 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	E2F3	O00716	465 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	RAD51B	O15315	384 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TRIM16	O95361	564 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	HGF	P14210	728 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	DGKA	P23743	735 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CTNNB1	P35222	781 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	MACC1	Q6ZN28	852 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	RTL10	Q7L3V2	364 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	TMEM25	Q86YD3	366 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ROPN1L	Q96C74	230 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	ZNF382	Q96SR6	550 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CCDC18-209	ENST00000481180	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.6	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms