RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 ART4Q93070 314 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CENPTQ96BT3 561 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 AP2M1Q96CW1 435 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NUS1Q96E22 293 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CFAP36Q96G28 342 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 APOLD1Q96LR9 279 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 RAXQ9Y2V3 346 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF711Q9Y462 761 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.56□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NEMP2A6NFY4 417 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 QSOX1O00391 747 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 SCAMP1O15126 338 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZW10O43264 779 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CSF2P04141 144 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PCCBP05166 539 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PDHA1P08559 390 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ALPIP09923 528 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PIRTP0C851 137 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 MYZAPP0CAP1 466 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CTSEP14091 401 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 TSHRP16473 764 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 MGAT1P26572 445 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 SPAM1P38567 509 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 MAGEA4P43358 317 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 TTPAP49638 278 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 TMPRSS15P98073 1019 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CACNG1Q06432 222 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 RALGDSQ12967 914 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ILKQ13418 452 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 KCNJ11Q14654 390 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 BRD3Q15059 726 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CDKN3Q16667 212 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 GPR33Q49SQ1 333 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 GUSBP11Q6P575 273 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 EMBQ6PCB8 327 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 KDELC1Q6UW63 502 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 MACC1Q6ZN28 852 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 OR4L1Q8NH43 312 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 IFI44Q8TCB0 444 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF398Q8TD17 642 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NXPE2Q96DL1 559 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 VPS39Q96JC1 886 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 SERPINB12Q96P63 405 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 RANBP9Q96S59 729 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC61Q9BV99 259 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ASB8Q9H765 288 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CASS4Q9NQ75 786 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 ZFATQ9P243 1243 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-205ENST00000467065 NFU1Q9UMS0 254 aa6.55□□□□□ -1.36
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