RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SNX2O60749 519 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 MTX2O75431 263 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 MT-CO3P00414 261 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 HALP42357 657 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 XIAPP98170 497 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SPIDRQ14159 915 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PTPRCAPQ14761 206 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TTC27Q6P3X3 843 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 NXPE1Q8N323 547 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ARL14Q8N4G2 192 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 KCNK6Q9Y257 313 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 U3KQA8 63 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 AGAP14A8MT82 685 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 NOBOXO60393 691 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 GSTM1P09488 218 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 MLNP12872 115 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 MYF5P13349 255 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 F3P13726 295 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PAMP19021 973 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PSMA3P25788 255 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 MAGEA6P43360 314 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 GSTM4Q03013 218 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CREG2Q8IUH2 290 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 MCUQ8NE86 351 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SLCO2A1Q92959 643 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 KLK13Q9UKR3 277 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 WASF3Q9UPY6 502 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SMAPO00193 183 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CCDC38Q502W7 563 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 IYDQ6PHW0 289 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CCNJLQ8IV13 435 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 SLC38A3Q99624 504 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.27■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 AP2A2O94973 939 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 ACRV1P26436 265 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 GRIA1P42261 906 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 NSG1P42857 185 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 FASLGP48023 281 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 DR1Q01658 176 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 ITIH4Q14624 930 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 CASC4Q6P4E1 433 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 NAGSQ8N159 534 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 SFRP1Q8N474 314 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 OR4L1Q8NH43 312 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 HDAC10Q969S8 669 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 SGSM3Q96HU1 749 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 STRADBQ9C0K7 418 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms