RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITIH5Q86UX2 942 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APOPT1Q96IL0 206 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC22A12Q96S37 553 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FUZQ9BT04 418 aa8.62□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP8B3O60423 1300 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMTNL1A8MU46 457 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR47O94967 919 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSH2P0DML3 217 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS7P49802 495 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF132P52740 706 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCNT1Q02742 428 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAF10Q12962 218 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTR4Q13639 388 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTL10Q7L3V2 364 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASB3Q9Y575 518 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL4A3Q01955 1670 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DIRC3C9JPN6 131 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF197O14709 1029 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 OCA2Q04671 838 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUBB3Q13509 450 aa8.6□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAF3Q5VWG9 929 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIGZQ86VD9 579 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGI4Q8N135 537 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.6□□□□□ -1.03
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