RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 GREM1O60565 184 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 AKAP3O75969 853 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 KIF20AO95235 890 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 BRD1O95696 1058 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 CHRNA1P02708 482 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 TFF1P04155 84 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 CSN3P07498 182 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 BLNKQ8WV28 456 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 FAM104AQ969W3 186 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 FAM136AQ96C01 138 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 SLC45A3Q96JT2 553 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 C12orf42Q96LP6 360 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 AGAP3Q96P47 875 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 CITED1Q99966 193 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 MYOCQ99972 504 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 SOSTQ9BQB4 213 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 TEX13BQ9BXU2 312 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 RAB33BQ9H082 229 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 CCSER2Q9H7U1 834 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 TLE6Q9H808 572 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 UBTD1Q9HAC8 227 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 SPG21Q9NZD8 308 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 TAAR2Q9P1P5 351 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 CTSZQ9UBR2 303 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD57-201ENST00000448188 SCOCQ9UIL1 159 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 MOB4Q9Y3A3 225 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 ATG4BQ9Y4P1 393 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 PATJQ8NI35 1801 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD57-201ENST00000448188 GBF1Q92538 1859 aa-0.61□□□□□ -2.51
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