RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 TNFAIP3P21580 790 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ADORA2BP29275 332 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 DRD3P35462 400 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CETN2P41208 172 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 NDST1P52848 882 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ARFIP2P53365 341 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 GSTM4Q03013 218 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TBCCQ15814 346 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 BCL2A1Q16548 175 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 NFIL3Q16649 462 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 MPP7Q5T2T1 576 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 C16orf46Q6P387 395 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CENPUQ71F23 418 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 LRRC6Q86X45 466 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 C12orf29Q8N999 325 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TCTN2Q96GX1 697 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 VPS50Q96JG6 964 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 LMLNQ96KR4 655 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 BIRC8Q96P09 236 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 C1orf21Q9H246 121 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 VPS11Q9H270 941 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TRABDQ9H4I3 376 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 S100A14Q9HCY8 104 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 FETUBQ9UGM5 382 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 KCTD3Q9Y597 815 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 HEATR9A2RTY3 570 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 MATN2O00339 956 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PDXKO00764 312 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TM9SF1O15321 606 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TYROBPO43914 113 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 RAD1O60671 282 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SPAG7O75391 227 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PCDH8O95206 1070 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TFAP2AP05549 437 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 SMIM18P0DKX4 95 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ETS2P15036 469 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 TCN2P20062 427 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 UGT1A3P35503 534 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ASPAP45381 313 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 RABIFP47224 123 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 VPS41P49754 854 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 AP3M2P53677 418 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 MTTPP55157 894 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CENPCQ03188 943 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 INCA1Q0VD86 236 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 CNTN1Q12860 1018 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 C1orf61Q13536 156 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 NCOA4Q13772 614 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 FZD2Q14332 565 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PDK3Q15120 406 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 ADGRF1Q5T601 910 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 AGBL4Q5VU57 503 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC6-210ENST00000441703 NEK5Q6P3R8 708 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms