RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437929.5

TOP3B-208, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 4

Gene TOP3B, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-208ENST00000437929 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CFAP58Q5T655 872 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TMEM135Q86UB9 458 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 FAM72BQ86X60 149 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 XYLT1Q86Y38 959 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 NRROSQ86YC3 692 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 EMC1Q8N766 993 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SMARCE1Q969G3 411 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 RTP4Q96DX8 246 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GSDMAQ96QA5 445 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 HAPLN3Q96S86 360 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 APMAPQ9HDC9 416 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 DKK3Q9UBP4 350 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 NEU3Q9UQ49 428 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.86□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 DLX3O60479 287 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 FUCA1P04066 466 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 THBDP07204 575 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CD8BP10966 210 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GM2AP17900 193 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 KELP23276 732 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 F8A1P23610 371 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 MMP12P39900 470 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GNPDA1P46926 289 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SNX16P57768 344 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TEKQ02763 1124 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 RALGDSQ12967 914 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 STIM1Q13586 685 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ERV3-1Q14264 604 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 NR1D2Q14995 579 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CYTH1Q15438 398 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 MANEALQ5VSG8 457 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TAF3Q5VWG9 929 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TTI2Q6NXR4 508 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ERAP2Q6P179 960 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 BNIPLQ7Z465 357 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 NAGSQ8N159 534 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 BMPERQ8N8U9 685 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 NELFBQ8WX92 580 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CCDC140Q96MF4 163 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 MAGEH1Q9H213 219 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 WDR26Q9H7D7 661 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CASS4Q9NQ75 786 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 LHX3Q9UBR4 397 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TSPAN11A1L157 253 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 B4E171 279 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ZW10O43264 779 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 DNAJB5O75953 348 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 KRT38O76015 456 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 STK17BO94768 372 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 SMC2O95347 1197 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CLDN1O95832 211 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 CPP00450 1065 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 ELFN1P0C7U0 828 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 DCTP40126 519 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 TSPAN7P41732 249 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-208ENST00000437929 GPR3P46089 330 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms