RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HDAC10Q969S8 669 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MFSD3Q96ES6 412 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RANBP9Q96S59 729 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDH19Q9H159 772 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TREX1Q9NSU2 369 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GULP1Q9UBP9 304 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HEATR9A2RTY3 570 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CPED1A4D0V7 1026 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A6NCN8 305 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRR19A6NJB7 356 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGRPO00253 132 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHUKO15111 745 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR1I1O60431 355 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNX2O60749 519 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAS8O95995 478 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PYGLP06737 847 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CKMT1AP12532 417 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITGALP20701 1170 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDHBP21912 280 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PSMA3P25788 255 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACRV1P26436 265 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAGEA3P43357 314 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BLKP51451 505 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDX1P52945 283 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACVR1Q04771 509 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NFE2L1Q14494 772 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NR0B2Q15466 257 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRADDQ15628 312 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 INSCQ1MX18 579 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNX20Q7Z614 316 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GKN2Q86XP6 184 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NAGSQ8N159 534 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARL10Q8N8L6 244 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM46DQ8NEK8 389 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR156Q8NFN8 814 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR150Q8NGU9 434 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF398Q8TD17 642 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STYXQ8WUJ0 223 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC6Q99741 560 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NRTNQ99748 197 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DPH5Q9H2P9 285 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAD18Q9NS91 495 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLC4Q9NSK0 619 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZZEF1O43149 2961 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDK2Q58EX2 2172 aa9.27□□□□□ -0.92
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGAP14A8MT82 685 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H7C0S8 307 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDK14O94921 469 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALPPL2P10696 532 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BRAFP15056 766 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CKMT2P17540 419 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACP1P24666 158 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADRA1DP25100 572 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITGA8P53708 1063 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms