RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 PSMD5Q16401 504 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CTF1Q16619 201 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD3Q96ES6 412 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 IL12RB2Q99665 862 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 RNF38Q9H0F5 515 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NEK6Q9HC98 313 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 POLE4Q9NR33 117 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 FAM172BPA6NC97 362 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NME4O00746 187 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 DYRK3O43781 588 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GPC4O75487 556 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 LCP1P13796 627 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 HSD17B1P14061 328 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CRHBPP24387 322 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CXCR2P25025 360 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PPM1AP35813 382 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFV1P49821 464 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CSRP3P50461 194 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GPR17Q13304 367 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 C11orf74Q86VG3 221 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 LACC1Q8IV20 430 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MTMR11A4FU01 709 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 LINC01553A4QN01 128 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CARNS1A5YM72 827 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 RNF103O00237 685 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SNPHO15079 494 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 DNAJB5O75953 348 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GLRBP48167 497 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GLUD2P49448 558 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ECT2LQ008S8 904 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ADIGQ0VDE8 80 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PRPSAP1Q14558 356 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ANO4Q32M45 955 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 VPS39Q96JC1 886 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF639Q9UID6 485 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 RFPL2O75678 378 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GRAP2O75791 330 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GFAPP14136 432 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ARPP19P56211 112 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SLC6A3Q01959 620 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 BHMTQ93088 406 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MUL1Q969V5 352 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SH3GL1Q99961 368 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 BAG5Q9UL15 447 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 HACD1B0YJ81 288 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 H0Y858 1186 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 LILRB3O75022 631 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 CPB1P15086 417 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SHMT2P34897 504 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 ACADSBP45954 432 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 SERPINB10P48595 397 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK11Q15759 364 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 DGUOKQ16854 277 aa16.68■□□□□ 0.26
CNGA3-205ENST00000436404 C14orf80Q86SX3 495 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms