RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 LAMA3Q16787 3333 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 UPK1AO00322 258 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MAP2K4P45985 399 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 HCAR3P49019 387 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 HTRA1Q92743 480 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FKBP10Q96AY3 582 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF560Q96MR9 790 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 PALMDQ9NP74 551 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 PDE10AQ9Y233 779 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FAM50BQ9Y247 325 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.3■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MYLKQ15746 1914 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GNGT2O14610 69 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 S1PR4O95977 384 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CYBBP04839 570 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CD1DP15813 335 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ALDH3A2P51648 485 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 DGKQP52824 942 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CD47Q08722 323 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM32Q13049 653 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SLC13A2Q13183 592 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MORN1Q5T089 497 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FRS2Q8WU20 508 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CDK15Q96Q40 435 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MROQ9BYG7 248 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ALPLP05186 524 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CCNCP24863 283 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CCR1P32246 355 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 DSC2Q02487 901 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GNASQ5JWF2 1037 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SPESP1Q6UW49 350 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SCAIQ8N9R8 606 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 ITFG1Q8TB96 612 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 TRMOQ9BU70 441 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 HMG20AQ9NP66 347 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 HPS4Q9NQG7 708 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SCN4AP35499 1836 aa15.29■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 M0R3G1 203 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MATN3O15232 486 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SLC22A3O75751 556 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CD4P01730 458 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 CPT1AP50416 773 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 IHHQ14623 411 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 LAPTM4AQ15012 233 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 SV2CQ496J9 727 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 STARD8Q92502 1023 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GMIPQ9P107 970 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 G3V2T6 193 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 HS6ST1O60243 411 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 MTHFD2P13995 350 aa15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SFRP4-201ENST00000436072 GSTM2P28161 218 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms