RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIK2Q9H0K1 926 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRC4Q9NPP4 1024 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 COMMD8Q9NX08 183 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYTH4Q9UIA0 394 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP83Q9Y592 693 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZZEF1O43149 2961 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PQF6 199 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 POM121BA6NF01 834 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ18B7U540 433 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC30A4O14863 429 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRAK2O43187 625 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBL1XO60907 577 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP3O75074 770 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOBTB1O94844 696 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUN1O94901 812 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNA14O95837 355 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERBB2P04626 1255 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR4A1P22736 598 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF4P23510 183 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-FP30511 346 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXA6P31267 233 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD70P32970 193 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY2P41231 377 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 STT3AP46977 705 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK7P49862 253 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 COG7P83436 770 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A3Q00325 362 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCNT1Q02742 428 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGFQ07326 219 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF844Q08AG5 666 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH18Q13634 790 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB32Q13637 225 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ12Q14500 433 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF234Q14588 700 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 STARD3Q14849 445 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF5Q15542 800 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2CD6Q53TS8 623 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 STPG1Q5TH74 334 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM215Q68D42 235 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GBP6Q6ZN66 633 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHST9Q7L1S5 443 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFN1Q8IWA4 741 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPP5Q8N3R9 675 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2C3Q8N628 320 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR56A3Q8NH54 315 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPT2Q8TD30 523 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPXM1Q96SM3 734 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCLK3Q9C098 648 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNCQ9H7C4 482 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIX2Q9NPC8 291 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS45Q9NRW7 570 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDIT4Q9NX09 232 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGA2Q9UJY4 613 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms