RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 PCSK7Q16549 785 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KLHL35Q6PF15 583 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CRTC3Q6UUV7 619 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PQLC3Q8N755 202 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GLYATL1Q969I3 302 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 FAF2Q96CS3 445 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 C9orf72Q96LT7 481 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 AGAP3Q96P47 875 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TGM7Q96PF1 710 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 OR6C1Q96RD1 312 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 WDR24Q96S15 920 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SPRY4Q9C004 299 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 APMAPQ9HDC9 416 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 POT1Q9NUX5 634 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 A6NCN8 305 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF487B1APH4 448 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 AKR1B10O60218 316 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KCNJ13O60928 360 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KATNA1O75449 491 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 C9P02748 559 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CASP14P31944 242 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 STAT5AP42229 794 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ARHGAP25P42331 645 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ARL4DP49703 201 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GSDMDP57764 484 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TAS2R40P59535 323 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC18A3Q16572 532 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 VSIG1Q86XK7 387 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RFX6Q8HWS3 928 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GPR26Q8NDV2 337 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SEC14L1Q92503 715 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PDE7BQ9NP56 450 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF711Q9Y462 761 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 CHUKO15111 745 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 NDUFA10O95299 355 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 NDST3O95803 873 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 DLGAP3O95886 979 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 UQCRHP07919 91 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 MMP2P08253 660 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PIRTP0C851 137 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PBX1P40424 430 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC19A1P41440 591 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 GFERP55789 205 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 KLRB1Q12918 225 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZBTB17Q13105 803 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 IHHQ14623 411 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SLC14A2Q15849 920 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 COLEC12Q5KU26 742 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 IRGCQ6NXR0 463 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ATCAYQ86WG3 371 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 TEX19Q8NA77 164 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 RAPGEF5Q92565 580 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 EPN3Q9H201 632 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 IFNKQ9P0W0 207 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PADI1Q9ULC6 663 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 POLHQ9Y253 713 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-210ENST00000431908 SPTA1P02549 2419 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms