RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428585.5

CARF-208, Transcript of calcium responsive transcription factor, human

TSL 2 BASIC

Gene CARF, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARF-208	ENST00000428585	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DHH	O43323	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	LARGE1	O95461	756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ACADS	P16219	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DDC	P20711	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	TTK	P33981	857 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	IDUA	P35475	653 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PDE1A	P54750	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ASIC1	P78348	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	OLR1	P78380	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	MTAP	Q13126	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CD302	Q8IX05	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ACOT7	O00154	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SYN3	O14994	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	GPR32	O75388	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SUPT3H	O75486	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DNAJB5	O75953	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	STAMBP	O95630	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PAEP	P09466	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SRC	P12931	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	GNAZ	P19086	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	NR1D1	P20393	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	RPA1	P27694	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	MPL	P40238	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PITPNB	P48739	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CCR3	P51677	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	EPHB3	P54753	998 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	GPS1	Q13098	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	ALX1	Q15699	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CARF-208	ENST00000428585	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms