RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 KDELC1Q6UW63 502 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 FAM117AQ9C073 453 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TSPY26PQ9H489 355 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 OGFRQ9NZT2 677 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.67■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 AURKAO14965 403 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 CST8O60676 142 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 PMPCBO75439 489 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 CDK14O94921 469 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 VIPP01282 170 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SLC19A1P41440 591 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 MAP7Q14244 749 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 BORAQ6PGQ7 559 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf72Q96LT7 481 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPER2Q96P56 530 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 FCRL5Q96RD9 977 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 HACD3Q9P035 362 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ13O60928 360 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 PPFIA2O75334 1257 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 UBXN7O94888 489 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 LCA5LO95447 670 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 BRAFP15056 766 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 NFKB1P19838 968 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK9P45984 424 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 WNT3AP56704 352 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD18Q0P651 414 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 P3H4Q92791 437 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 UBP1Q9NZI7 540 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 ALG6Q9Y672 507 aa20.65■□□□□ 0.9
LIMS1-208ENST00000428064 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 HACD1B0YJ81 288 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MTX2O75431 263 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 STK17BO94768 372 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 DLGAP3O95886 979 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TNNT1P13805 278 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 VCLP18206 1134 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DPA1P20036 260 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 IDSP22304 550 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 DMPKQ09013 629 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CLCA4Q14CN2 919 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 APMAPQ9HDC9 416 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 IL26Q9NPH9 171 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 IL17CQ9P0M4 197 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.64■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SPAM1P38567 509 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CAPZBP47756 277 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GFERP55789 205 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY2Q08462 1091 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MPP3Q13368 585 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2H3Q13889 308 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SLC1A5Q15758 541 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms