RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX20Q7Z614 316 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIER2Q8N344 545 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BOCQ9BWV1 1114 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLPBQ9H078 707 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB8Q9H765 288 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL26Q9NPH9 171 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BBIP1A8MTZ0 92 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEX1O43933 1283 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00271P0C7V0 271 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NME5P56597 212 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBBP7Q16576 425 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAYNQ6UX15 382 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSWIM9Q86XI8 627 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBFAQ8N0V3 343 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GATA6Q92908 595 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CIPCQ9C0C6 399 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EBF3Q9H4W6 596 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APPL1Q9UKG1 709 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CROTQ9UKG9 612 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR5A2O00482 541 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MATN4O95460 622 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UROSP10746 265 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGALP20701 1170 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AQP4P55087 323 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OGFOD2Q6N063 350 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RETREG3Q86VR2 466 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELMOD1Q8N336 334 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAT14Q8WUY8 206 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROPN1LQ96C74 230 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCNAQ96QF7 691 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CORO1BQ9BR76 489 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRORSD1PA6NEY8 169 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADH1AP07327 375 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRR35P0CG20 571 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IDO1P14902 403 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BPIP17213 487 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINA4P29622 427 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK19P49842 368 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RALGDSQ12967 914 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XKR7Q5GH72 579 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SBSNQ6UWP8 590 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VOPP1Q96AW1 172 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMLNQ96KR4 655 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM181Q9P2C4 612 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.5■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEA13PA6NCF6 341 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIPC1O14908 333 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAIAP3O94812 1187 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCL14O95715 111 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHEK2O96017 543 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRCP12931 536 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRA10AC1Q70Z53 315 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA24Q86W54 205 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF382Q96SR6 550 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC39A3Q9BRY0 314 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VCXQ9H320 206 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASAH2Q9NR71 780 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD300AQ9UGN4 299 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYBBP04839 570 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN3P20807 821 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACRV1P26436 265 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-FP30511 346 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms