RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKAA2P54646 552 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TPTEP56180 551 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FMO1Q01740 532 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTN1Q12860 1018 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CHI3L2Q15782 390 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 UBXN11Q5T124 520 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CDK20Q8IZL9 346 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MREGQ8N565 214 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 AGR3Q8TD06 166 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TOP1MTQ969P6 601 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OTUB2Q96DC9 234 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEH1Q9H213 219 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ASB8Q9H765 288 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.39□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CLCA1A8K7I4 914 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPBD1B2RD01 187 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SCAMP1O15126 338 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TM9SF1O15321 606 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SSX4O60224 188 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR32O75388 356 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 WFS1O76024 890 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GNAO1P09471 354 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BMP6P22004 513 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPK1P28482 360 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPN6P29350 595 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNGR2P38484 337 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEA11P43364 429 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CBX5P45973 191 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BLKP51451 505 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFB103AP81534 67 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GNA12Q03113 381 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GRM2Q14416 872 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HERC3Q15034 1050 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SSX2Q16385 188 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LONRF1Q17RB8 773 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ATAD3CQ5T2N8 411 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GALNT18Q6P9A2 607 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFB123Q8N688 67 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 AGAP11Q8TF27 550 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3R3Q92569 461 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SERAC1Q96JX3 654 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CPXM1Q96SM3 734 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NELL2Q99435 816 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RDH8Q9NYR8 311 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SPASTQ9UBP0 616 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF112Q9ULX5 631 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 UBR2Q8IWV8 1755 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 E9PAM4 449 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMD11O00231 422 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 AP3D1O14617 1153 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF185O15231 689 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB14O43829 449 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GABBR2O75899 941 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL18O95568 372 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PEPDP12955 493 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GOT1P17174 413 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TPH1P17752 444 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ITGB6P18564 788 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NR4A1P22736 598 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MMP8P22894 467 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTFP26441 200 aa4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM34P42696 430 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3CGP48736 1102 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms