RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPN8A6NHC0 703 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSGN1A6NI15 193 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC154A6NI56 674 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 AQP7P3A6NL99 342 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFP92A6NM28 416 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0YIN7 160 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF195O14628 629 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM12O43184 909 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNAP91O60641 907 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ULK1O75385 1050 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSPG5O95196 566 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEF2P13639 858 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TYRP14679 529 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGXTP21549 392 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPHA2P29317 976 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGT5P36269 586 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CCR5P51681 352 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSCP53634 463 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGA8P53708 1063 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAX9P55771 341 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 HERVK_113P61574 105 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE1BQ01064 536 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGALS3BPQ08380 585 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0040Q15053 153 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM88Q6PEY1 159 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR5BQ86VZ2 330 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM25Q86YD3 366 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 CMIPQ8IY22 773 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADSSL1Q8N142 457 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB119Q8N690 84 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2W6PQ8NHA6 318 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTSF1Q8WW33 167 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSMAFQ92636 917 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 APIPQ96GX9 242 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A13Q96QE2 648 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP3K3Q99759 626 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GLT8D2Q9H1C3 349 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM83DQ9H4H8 585 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACAD9Q9H845 621 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPRE3Q9UPY8 281 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 HERC1Q15751 4861 aa-1.1□□□□□ -2.58
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC14L2O76054 403 aa-1.1□□□□□ -2.59
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RNU6-172P-201ENST00000411000 HDAC4P56524 1084 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLIN5Q00G26 463 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDR2Q01850 454 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR17Q13304 367 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACVR2BQ13705 512 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ME3Q16798 604 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP4A22Q5TCH4 519 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAET1LQ5VY80 246 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYB5R2Q6BCY4 276 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCP5Q6MZN7 132 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CGB2Q6NT52 195 aa-1.1□□□□□ -2.59
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