RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 CEACAM5P06731 702 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SKILP12757 684 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CCNB1P14635 433 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ITIH1P19827 911 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TEAD1P28347 426 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ARL4AP40617 200 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MAXP61244 160 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CDK3Q00526 305 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 B4GALNT1Q00973 533 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LY6DQ14210 128 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NR1D2Q14995 579 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 IQCB1Q15051 598 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PTPRRQ15256 657 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TGIF1Q15583 401 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 BOLA3Q53S33 107 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF605Q86T29 641 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TEKT4Q8WW24 435 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HSPH1Q92598 858 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MKS1Q9NXB0 559 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PISDQ9UG56 409 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.94□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 A0A096LPE4 126 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PPZ6 126 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SMTNL1A8MU46 457 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 HTR3BO95264 441 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NAT2P11245 290 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 RHCEP18577 417 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 IL4RP24394 825 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SERPINB6P35237 376 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PBX1P40424 430 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ETV5P41161 510 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ETV3P41162 512 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MMP13P45452 471 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 CDH6P55285 790 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 IHHQ14623 411 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NR1I3Q14994 352 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 Q6ZVL8 140 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 DTX1Q86Y01 620 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NXPE1Q8N323 547 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TEX26Q8N6G2 289 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 NAXEQ8NCW5 288 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 FAM71BQ8TC56 605 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM159Q96B96 161 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SCRN2Q96FV2 425 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 BTBD6Q96KE9 485 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 THAP2Q9H0W7 228 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 A0A0U1RQS6 177 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PQJ5 194 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf172C9J069 976 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 B4GAT1O43505 415 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 MFSD11O43934 449 aa6.93□□□□□ -1.3
CTXN3-201ENST00000379445 PRAMEF10O60809 474 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms