RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1024LP59773 190 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 NFATC4Q14934 902 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TYSND1Q2T9J0 566 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 COPS8Q99627 209 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 KCNH6Q9H252 994 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 SENP1Q9P0U3 644 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO5Q9UKT4 447 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa29.24■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 NR1D1P20393 614 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 AKT1P31749 480 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 OVGP1Q12889 678 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 DOK6Q6PKX4 331 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 LOXL4Q96JB6 756 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 BOCQ9BWV1 1114 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM39Q9HCM9 518 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 GPR27Q9NS67 375 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 MYO15AQ9UKN7 3530 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 DMDP11532 3685 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM202A6NGA9 273 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TLR4O00206 839 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ASMTLO95671 621 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 HTR1BP28222 390 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TMED2Q15363 201 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 CTAGE3PQ8IX95 158 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 CYP4X1Q8N118 509 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PPM1NQ8N819 430 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TCF12Q99081 682 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TBK1Q9UHD2 729 aa29.23■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 VILLO15195 856 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFS3O75489 264 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 MSH3P20585 1137 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 DPP6P42658 865 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 POLD2P49005 469 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 MPP1Q00013 466 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 B4GALNT1Q00973 533 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 OR2AG1Q9H205 316 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ATXN10Q9UBB4 475 aa29.22■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 RRP9O43818 475 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 OR1I1O60431 355 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 S1PR4O95977 384 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 KELP23276 732 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD12P35452 270 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PTK2BQ14289 1009 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ITIH4Q14624 930 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TEAD4Q15561 434 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 LGSNQ5TDP6 509 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC3L1Q86VI1 746 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 DCUN1D1Q96GG9 259 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 WDR92Q96MX6 357 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 FAM86C1Q9NVL1 165 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PSAT1Q9Y617 370 aa29.21■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 PFDN6O15212 129 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 EPN2O95208 641 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 CNTFP26441 200 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINB9P50453 376 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF789Q5FWF6 425 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ENPP7Q6UWV6 458 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 MACC1Q6ZN28 852 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0408Q6ZU52 694 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 TRABD2AQ86V40 505 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 RBFAQ8N0V3 343 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 NAT14Q8WUY8 206 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 HEXDCQ8WVB3 486 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 SKA1Q96BD8 255 aa29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
ECHS1-201ENST00000368547 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEC1O60732 1142 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 CEACAM5P06731 702 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 RALBP11234 206 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 C21orf59P57076 290 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 PPP2R2AP63151 447 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 LAIR1Q6GTX8 287 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 SUMF1Q8NBK3 374 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 OR56A4Q8NGH8 313 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 FGF22Q9HCT0 170 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa29.2■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 PI4KAP42356 2102 aa29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms