RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G6O60733 806 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 IL1AP01583 271 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ACP5P13686 325 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CHN1P15882 459 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CHRNB4P30926 498 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 DCTP40126 519 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 TRPC1P48995 793 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 VSNL1P62760 191 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC24Q50LG9 513 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 RUFY3Q7L099 469 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 C14orf80Q86SX3 495 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC13Q8IYE1 715 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 AFAP1Q8N556 730 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 TTC8Q8TAM2 541 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf50Q8WW18 174 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 LZICQ8WZA0 190 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 TTC17Q96AE7 1141 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 DHX58Q96C10 678 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ART5Q96L15 291 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00479Q96M42 142 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 NUP58Q9BVL2 599 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 STK33Q9BYT3 514 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 NDST4Q9H3R1 872 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ZWILCHQ9H900 591 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ANO10Q9NW15 660 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 DACT1Q9NYF0 836 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 DIP2AQ14689 1571 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 UBN2Q6ZU65 1347 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 CD163L1Q9NR16 1453 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 PPLO60437 1756 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ECM29Q5VYK3 1845 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 AGLP35573 1532 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-202ENST00000367364 ENO4A6NNW6 628 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 HHLA1C9JL84 531 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 DVL1O14640 695 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 FIBPO43427 364 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 STX10O60499 249 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 PFKFB2O60825 505 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 GSTA1P08263 222 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 PAEPP09466 180 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 SULT2A1Q06520 285 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 POSTNQ15063 836 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ATL3Q6DD88 541 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 KMT5CQ86Y97 462 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 VSTM4Q8IW00 320 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CD302Q8IX05 232 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC43Q8N309 656 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 NME8Q8N427 588 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 IRGQQ8WZA9 623 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF570Q96NI8 536 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 SPAG5Q96R06 1193 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CAPS2Q9BXY5 557 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 PRR34Q9NV39 138 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 THAP1Q9NVV9 213 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC6Q9UBN7 1215 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms