RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HACD3Q9P035 362 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PISDQ9UG56 409 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BSNQ9UPA5 3926 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SDK2Q58EX2 2172 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.57□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 A6NCN8 305 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AGRPO00253 132 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CHUKO15111 745 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KMOO15229 486 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KLK10O43240 276 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DUX1O43812 170 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 VEGFDO43915 354 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SNX2O60749 519 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PPFIA2O75334 1257 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MTX2O75431 263 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 F3P13726 295 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ITIH1P19827 911 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PSMB4P28070 264 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CD1CP29017 333 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC5A2P31639 672 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CSF2RBP32927 897 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SPAM1P38567 509 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UCNP55089 124 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS3P57727 454 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CXADRP78310 365 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GPLD1P80108 840 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HHEXQ03014 270 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 INSCQ1MX18 579 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 USP53Q70EK8 1073 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LRRTM4Q86VH4 590 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GDAP1Q8TB36 358 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM159Q96B96 161 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA13Q96N96 652 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A3Q99624 504 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CMKLR1Q99788 373 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FICDQ9BVA6 458 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRORYQ9H606 182 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KLC4Q9NSK0 619 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IL17CQ9P0M4 197 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PKP3Q9Y446 797 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.56□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JNG1 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CES2O00748 559 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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SGMS1-201ENST00000361543 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GPR39O43194 453 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF10O60809 474 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CDK14O94921 469 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AGTP01019 485 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ETV5P41161 510 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CLCNKAP51800 687 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LIMK2P53671 638 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK10P53779 464 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS12P56730 875 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NFATC2Q13469 925 aa7.55□□□□□ -1.2
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