RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD18Q9NS91 495 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF21Q9NSA1 209 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KCND1Q9NSA2 647 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KLC4Q9NSK0 619 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CD84Q9UIB8 345 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TCFL5Q9UL49 500 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TLCD2A6NGC4 264 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 F5H423 210 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KMOO15229 486 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ13O60928 360 aa7.73□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 EML2O95834 649 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TPM2P07951 284 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MMEP08473 750 aa7.73□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB6P35237 376 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 HADHAP40939 763 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH6P55285 790 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ITKQ08881 620 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PKP1Q13835 747 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2H3Q13889 308 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MYBPC3Q14896 1274 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCL1Q15111 1095 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MARC1Q5VT66 337 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR59Q6PJI9 974 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM74Q86UV6 250 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.73□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MGME1Q9BQP7 344 aa7.73□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.73□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0J9YYE9 177 aa7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 CCP110O43303 1012 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPSAP2O60256 369 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ZG16O60844 167 aa7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SOD1P00441 154 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBC1P01850 177 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 CTPS1P17812 591 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ERCC2P18074 760 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL4AP40617 200 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP13P45452 471 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 STC1P52823 247 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.72□□□□□ -1.17
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PGGT1B-201ENST00000296642 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RSC1A1Q92681 617 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF31Q96EP0 1072 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 MCEEQ96PE7 176 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST8Q9H2A9 424 aa7.72□□□□□ -1.17
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